SEO kavramı ile uğraşanlar indexleme olayını bilirler. Bir sitenin Google, Bing veya Yandex indexleme sayıları farklıdır çünkü tüm arama motorlarının algoritması özgündür. Deepweb te indexlenmeyen yani internette sansürlenmiş veya hiç Arama motorlarının robotları tarafından bulunamayan ve indexlemediği içeriklerin olduğu bir katmandır. DeepWeb'de siteler dinamik içeriklerden oluşur ve arama motorları bu dinamik içerikli siteleri takip edemez.
Site adresleri genelde .onion domain uzantılı dır. Zaten bu domain uzantısı sadece TOR sistemine ait olduğu için, başka Web tarayıcılarında açılmaz ve otomatikman hiçbir Arama motoru tarafından görüntülenemez. Deepweb'de siteler çok basittir. Aşırı görselli, animasyonlu ve filmlerdeki gibi bilgisayarlardan girilen System Login tarzında paneller yoktur, Bildiğiniz basit HTML sitelerdir.